OSとアプリケーションのクリーンインストールとは
クリーンインストールとは、その言葉の通りきれいな環境にインストールすることを指します。
OSやアプリケーションできれいな環境とは、関連するデータやプログラムのない状態を指します。
アプリケーションのクリーンインストールとは
アプリケーションのクリーンインストールとは、インストールされているアプリケーションを一度アンインストールを行いデータを削除した後のきれいな状態（アプリケーションデータ的に）にインストールすることを指します。
アプリケーションの動作が不安定なときや、アップデートが上手く行かないときにインストーラやトラブルシューティングで実行を促されます。
OSのクリーンインストールとは
OSのクリーンインストールとは、OSをインストールするストレージメディアをフォーマット（初期化）して、まっ更な状態にした後にOSをインストールすることです。
OSのバージョンアップは、同じ環境で新しいOSを使用できて便利ですが、前のバージョンのファイルや設定の互換性に問題がったり、インストーラの不備による動作の不安定やパフォーマンスの低下が常に考えられます。
OSのクリーンインストールは、動作が重くなった時のトラブルシューティングで第一に促される手段です。
クリーンインストールの注意点
アプリケーションのクリーンインストールや、OSのクリーンインストール両方に言える注意点としては、データや環境の引き継ぎがないので実行までにバックアップをしておくことをお勧めします。